旧根占町、旧佐多町の両町で構成された南大隅町は、大隅半島の南部にあり、九州本島最南端の佐多岬を有しています。

北緯31度線を擁する町としては、カイロ、上海、ニューオーリンズ、ニューデリーなどがあります。

南東側は大隅海峡、西側は鹿児島湾（錦江湾）に面しており、三方を海に囲まれた半島の先端の町であり、西には薩摩半島の指宿市、南には種子島、屋久島等があります。

面積は214平方キロで、鹿児島県全体の2.3%を占めますが、地域内の可住地面積比率は19%となっています。