屋久島町は、鹿児島市の南方約135ｋｍ、県本土の南方約60ｋｍの海上にあり、屋久島とその西北西約12ｋｍにある口永良部島の２島からなってます。 総面積は540.48ｋ㎡で、内93％を占める屋久島は周囲132ｋｍの円形の島で九州最高峰の宮之浦岳（1,936ｍ）を筆頭に、標高1,000ｍ以上 の山が４５座以上あり、多くを山岳部分で占められていることから、洋上アルプスと呼ばれています。このため傾斜地が多く平坦地が乏しく、一圃場当たりの区 画面積が狭い島です。１９９３（平成５）年には、樹齢数千年の屋久杉をはじめとする特殊な森林植生や、亜熱帯から冷温帯に及ぶ植生の垂直分布など、屋久島 の貴重な自然環境・自然資源が世界的な評価を受け、我が国で最初の世界自然遺産に登録されました。気象は多量な雨が特徴的で、年間平均降水量は平地で約4,500ｍｍ（山間部は8,000～10,000ｍｍ）と、日本の年間平均降水量の２倍をはるかに 超える量で、その半分近くが５月から８月に集中します。気温は、亜熱帯に位置しているため、平地では年間平均気温約２０度と温暖ですが、屋久島においては その標高差により亜熱帯から冷温帯の植生分布がみられる特異性から、山岳部では、冬季には積雪もみられます。

　口永良部島は、長径12ｋｍ、最大幅5ｋｍの美しい緑の火山島で、今なお噴煙をたなびかせる新岳（標高626ｍ）がそびえ、島の海岸周辺の随所には良質な 温泉が湧き出ています。また島の面積の３割以上を竹林が占め、比較的傾斜の緩やかな地域は天然の牧野の役割を果たしています。