小金井市は東京都のほぼ中央部に位置し、市域全体が住宅地となっています。 市の中央をJR中央本線が東西に走り、東部には西武多摩川線が南に延びています。 JR武蔵小金井駅には公共施設や商業施設が集まり、市の中心地となっています。 東京農工大学や法政大学、東京学芸大学と大学や研究施設が多く、文教都市の側面もあります。 北部には玉川上水、南部には野川が市域を横断しており、水辺の緑地が整備されている他、市内には地下水が湧き出る場所がいくつかあり、東京の名湧水にも選ばれています。 これにより地下水と湧水の保全活動が活発です。